Генетическая изменчивость шиповника острозубого (Rosa oxyodon) по ISSR-маркерам
https://doi.org/10.33580/24092444_2024_2_46
Аннотация
На практике тяжело отличить близкие виды друг от друга, что, как правило, связано с высоким внутривидовым полиморфизмом. Целью данной работы является оценка изменчивости видов R. oxyodon, R. prokhanovii и R. sosnovskyana. На первом этапе было проанализировано 42 морфологических признака. Эти же образцы были изучены в отношении полиморфизма ISSR маркеров и изменчивости хлоропластного спейсера trnL-trnF. Анализ морфологических признаков R. oxyodon, R. prokhanovii и R. sosnovskyana методом главных координат показал невозможность их строгой дифференциации, как самостоятельных и равнозначных видов. Такой же результат получен при анализе полиморфизма 115 ISSR маркеров. Данные по изменчивости хлоропластного спейсера trnL-trnF вышеназванных видов также показывали, что существующий полиморфизм не связан с разделением на три вида.
При поддержке: Автор выражает признательность и глубокую благодарность И. А. Шанцеру, познакомившему меня с молекулярногенетическими методами и З. М. Асадулаеву за помощь на всех этапах, полезные советы и замечания.
Об авторе
Б. А. Рамазанова
Горный ботанический сад – ОП ДФИЦ РАН
Россия
Россия
Рамазанова Байзанат Абакаровна, кандидат биологических наук, младший научный сотрудник Лаборатории интродукции и генетических ресурсов древесных растений
367000, г. Махачкала, ул. М. Гаджиева, 45
Список литературы
1. Anderson E. C., Thompson E. A. 2002. A model-based method for identifying species hybrids using multilocas genetic data. Genetics 160: 1217–1229.
2. Buntjer J. B. 2000. Cross Checker: computer assisted scoring of genetic AFLP data. Plant & Animal Genome VIII Conference. San Diego: 945–959.
3. [Buzunova] Бузунова И. О., Камелин Р. В. 2004. Виды рода Rosa L. (Rosaceae) секции Cinnamomeae DC. во флоре Кавказа. Новости систематики высших растений 36: 112–122.
4. Clement M., Posada D., Crandall K. A. 2000. TCS: a computer program to estimate gene genealogies. Molecular Ecology 9: 1657–1659.
5. Doyle J. J., Doyle J. L. 1987. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin 19: P. 11–15.
6. Falush D., Stephens M., Pritchard J. 2007. Inference of population structure using multilocus genotype data: dominant markers and null alleles. Molec. Ecol. Notes 7: 574–578.
7. [Fedorova] Федорова А. В. 2014. Систематика и география видов рода Rosa L. секц. Gallicanae DC. Автореферат. дис. … канд. биол. наук. Москва: 21с.
8. [Gadzhieva] Гаджиева С. В. 2020. Изучение генетического разнообразия генотипов дикого граната (Punica granatum L.) Азербайджана с использованием маркеров ISSR. Вестник КрасГАУ 3: 20–28.
9. [Grant] Грант В. 1984. Видообразование у растений. Москва: 528 с.
10. [Grusheckaya] Грушецкая З. Е., Никитинская Т. В., Кубрак С. В., Дзюбан О. В., Кухарева Л. В., Поликсенова В. Д., Титок В. В., Лемеш В. А., Парфенов В. И., Хотылева Л. В. 20012. Использование ISSR-анализа для изучения внутри- и межвидового генетического полиморфизма различных таксонов высших растений. Вестник БГУ 3: 50–56.
11. Hall A. T. 1999. BioEDit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Oxford Unifersity Press. Nucleic Acids Symposium Series 41: 95–98.
12. Hammer O., Harper D.A.T., Ryan P. D. 2001. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis. Paleontologia Electronica 1: 49.
13. [Kalendar'] Календарь Р. Н., Глазко В. И. 2002. Типы молекулярно-генетических маркеров и их применение. Физиология и биохимия культурных растений 4: 279–293.
14. [Kashin] Кашин А. С., Крицкая Т. А., Шанцер И. А. 2016. Генетический полиморфизм Tulipa gesneriana L. по данным ISSR маркирования. Генетика 10: 1134–1145.
15. [Kolobov] Колобов Е. С. Шиповники Дагестана. 1985. Автореф. дис. … канд. биолог. наук. Москва: 11 с.
16. [Kucev] Куцев Г. М. 2009. Фрагментарный анализ ДНК растений: RAPD, DAF, ISSR. Барнаул: 164 с.
17. Kumar M., Mishra G. P., Singh R., Kumar J., Naik P. K., Singh S. B. 2009. Correspondence of ISSR and RAPD markers for comparative analysis of genetic diversity among different apricot genotypes from cold arid deserts of trans-Himalayas. Physiology and Molecular Biology of Plants 3: 225–236.
18. Neve G., Meglecz E. 2000. Microsatellite frequencies in different taxa. Trends in Ecology & Evolution 15: 3321–3323.
19. [Ramazanova] Рамазанова Б. А. 2012. Структура, ресурсный потенциал дагестанских популяций и филогенетические связи шиповника острозубого (Rosa oxyodon Boiss.). Автореф. дис. … канд. биолог. наук. Ставрополь: 20 с.
20. Saki S., Bagheri H., Deljou A., Zeinalabedini M. 2016. Evaluation of genetic diversity amongst Descurainia sophia L. genotypes by inter-simple sequence repeat (ISSR) marker. Physiology and Molecular Biology of Plants 22: 97–105.
21. Shahi-Gharahlar A., Zamani Z., Fatahi R., Bouzari N. 2011. Estimation of genetic diversity in some Iranian wild Prunus subgenus Cerasus accessions using inter-simple sequence repeat (ISSR) markers. Biochem Syst Ecol 4–6: 826–833.
22. [Shancer] Шанцер И. А., Войлокова В. Н. 2008. Сколько видов, родственных Rosa majalis, растет в Европейской части России? Ботанический журнал 93: 1690–1704.
23. Taberlet P, Gielly L, Pautou G, Bouvet J. 1991. Universal primers for amplification of three noncoding regions of chloroplast DNA. Plant Molecular Biology 17: 1105–1109.
24. [Tahtadzhyan] Тахтаджян А. Л. Жизнь растений. Т. 1. 1974. М.: 49–57.
25. Templenton A. R., Crandall K. A., Sing C. F. 1992. A cladistic analysis of phenotypic associations with haplotypes inferred from restriction endonuclease mapping and DNA sequence data III. Cladogram estimation. Genetics 132: 619–633.
26. Tharwat R., Mazen N., Hafez M. 2018.Genetic Diversity of Rosa Damascena Mill. in Latakia Province as Reveled by ISSR Analysis. SSRG International Journal of Agriculture&Environmental Science 6: 18–22.
27. Zahid N. S., Vikas S., Rafiq A. S., Neha S., Baby S., Fahad A., Hamed A., Javid I. M. 2021. Genetic diversity analysis and population structure in apricot (Prunus armeniaca L.) grown under north-western Himalayas using ISSR markers. Saudi Journal of Biological Sciences 10: 5986–5992.
28. [Zavadskiy] Завадский К.М. 1968. Вид и видообразование. Л: 404 с.
Рецензия
Для цитирования:
Рамазанова Б.А. Генетическая изменчивость шиповника острозубого (Rosa oxyodon) по ISSR-маркерам. Ботанический вестник Северного Кавказа. 2024;(2):46–56. https://doi.org/10.33580/24092444_2024_2_46
For citation:
Ramazanova B.A. Genetic variability of wild rose (Rosa oxyodon) by ISSR-markers. Botanical Journal of the North Caucasus. 2024;(2):46–56. (In Russ.) https://doi.org/10.33580/24092444_2024_2_46
Просмотров:
25
Послать статью по эл. почте 